科目名 Course Title	生命情報学概論(2)［24N3027］ Introduction to Bioinformatics (2)
授業言語 Language	Japanese
科目区分・科目種	全学共通科目	クラス	全学科
コンピテンシー	○創造的思考力	ｶﾗｰｺｰﾄﾞ
単位数	1.0単位	履修年次	1〜4年

担当教員	由良　敬
学期	２学期
曜日・時限・教室	火曜 9 〜 10 限 共通講義棟1号館205室

(1)、(2)が付く科目の履修方法
この科目は、(1)及び(2)を連続して履修してください（シラバスは両方とも確認してください）。 ただし留学により連続して履修できない場合は、担当教員に申し出てください。

受講条件・その他注意
高校までの生物学を知っていれば大丈夫です。生命情報学概論（１）を履修してから受講してください。なお授業資料はすべてMoodleを通して配付するので、授業前にMoodleを確認すること。

授業の形態
講義

教科書・参考文献
教科書・参考文献は特にありません。

ＡＬＨ区分
ＡＬＨ（自発的な学習時間枠）※を実施する

アクティブラーニングの技法
復習テスト

評価方法・評価割合
期末試験=70％，小論文（レポート）=20％，授業への参加態度=10%

主題と目標

過去３０年間に、ヒトをはじめ様々な生物のゲノムすべてを読み取ることができるようになりました。これらの分子生物データを解析解釈することで、生命現象の理解が大きく進歩します。生命情報学はこれら大量データを解析するために、物理学、化学や情報科学を生命科学に導入して生まれてきた学問です。この科目では、（１）生命情報学の歴史、（２）生命情報学が扱うデータの概要、および（３）生命を情報からとらえたときにどのようなことがわかるのか概観します。特にタンパク質の構造と機能に関することを重点的に扱います。この科目の履修にあたって予備知識は必要としません。必要な物理学、化学、情報科学は、授業内でできるだけ説明するようにします。そのため授業時間内に受講生諸君に対して頻繁に質問をします。受講生諸君からの質問はいつでも受けます。簡単な計算問題を行う時もありますので、四則演算ができる計算機は毎回持参してください。生命情報学に必要な計算手法の詳細は、別科目（計算生物学）で取り扱います。これらの活動を通して、「生命情報学（バイオインフォマティクス）」が、生物学の疑問にどのような計算手段で回答を与えてきたかを理解できるようになることを本講義の目標とします。

授業計画
第1回	はじめに。 タンパク質の生物学的機能を知る。
第2回	タンパク質の進化について概観する
第3回	タンパク質の進化について具体的な例を知る。
第4回	タンパク質の立体構造予測の方法を理解する。
第5回	タンパク質の機能予測方法を理解する。
第6回	ALH:ランダム配列の進化を計算してみよう。
第7回	ＳＮＰ（塩基置換）現象が何をもたらすのかを理解する。
第8回	オミックスの時代に実施すべきバイオインフォマティクスを考える。
第9回	理解度を測定する（期末試験）。

時間外学習
生命科学現象には、情報や計算からわかる現象がたくさんあります。それらを探してください。

学生へのメッセージ
授業には積極的に参加してください。考えながら講義に参加し、疑問がわいたらその場で質問をしましょう。後から質問をされても、コンテクストがわからなくなっているので、答えることができません。

学生の問い合わせ先
理学部１号館６１１室